對游泳池水消毒是一個非常重要的環節，這個環節如果處理不好，游泳池便有可能成為傳播疾病的場所。從而影響運動員進行訓練和人們鍛煉身體的積極作用。
游泳池水溫適宜，水中又有充分的有機物來源，是傷寒、痢疾、肝炎、急性結膜炎、膿皰病等致病菌的適宜生長環境。
此外，除了細菌還有許多種病毒的危害，例如：肝炎病毒及性病病毒等往往是通過水的途徑來傳播疾病的。因此，對游泳池水消毒的必要性是十分明顯的。
游泳池消毒藥品(設備)有許多種，其選擇應符合下列要求：
(1)所采用的消毒方式，必須具有強烈的殺菌作用，即在30秒內消滅99．99％的微生物。
(2)滅菌效果應有合理的延續時間，能使游泳者帶入池中的污染物被有效地控制住。
(3)在消毒的同時不能有二次污染，即對人體或環境造成新的危害。
(4)管理操作方便，投加量必須容易控制。
(5)設備投資和運行費用必須具有合理的經濟性。
池水消毒處理系統
目前用于游泳池水常用消毒方法、消毒的藥品(設備)主要有液氯、次氯酸鈉發生器、臭氧等。
液氯
液氯含有100％的有效氯，殺菌力強，并有較強的持續殺菌能力，加之設備投資和材料消耗費用低，是一種較為成熟的消毒劑，被各地廣泛地應用。但液氯做為消毒劑，對人體和環境造成的二次污染也很明顯。
次氯酸鈉發生器
次氯酸鈉發生器是將鹽水電解后生成次氯酸鈉溶液。有機氯化物和氯酚的生成極少，在適宜的濃度時，其消毒效果與液氯相同，其優點是無嗅、無味，設備簡單、投資少。但其缺點是發生器的重要部件游泳池水處理設備一電極易損，電耗、鹽耗相對較大。
臭氧
臭氧消毒效率高，有極強的氧石英砂過濾器化能力，對各種病毒、細菌均游泳池循環水處理有殺滅能力，對降解各種有機毒物，景觀水處理設備除色、除嗅、除味，改善水質效果極佳。但臭氧裝置比較復雜、占地面積極大，設備投資昂貴，系統繁雜，運轉費用大，在游泳池水凈化中還在推廣應用階段。